Die Abteilung Computational Metagenomics am Institut für Bio- und Geowissenschaften – Computergestützte Metagenomik (IBG-5) widmet sich bioinformatischen Forschungsaktivitäten mit dem Fokus auf die interdisziplinäre Entschlüsselung und Analyse von Metagenomen. Schwerpunkt ist insbesondere der Einsatz von Cloud-Technologien zur Analyse großer Datenmengen und zur Unterstützung verschiedener Anwendungen in den Lebenswissenschaften sowie der Biomedizin. Das IBG-5 integriert dabei sowohl auf nationaler (de.NBI) als auch auf internationaler Ebene (ELIXIR) Service- und Infrastrukturnetzwerke, um solche Datenanalysen sowohl für die wissenschaftliche Gemeinschaft als auch für die Endanwender:innen effizienter und automatisierter zu gestalten.
Zur Unterstützung unserer Abteilung suchen wir zum nächstmöglichen Zeitpunkt einen
Wissenschaftlichen Mitarbeiter – Entwicklung, Anwendung und Evaluierung von Methoden der Hochdurchsatz-Metagenomik in cloudbasierten Ausführungsumgebungen (w/m/d)
Ihre Aufgaben:
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Arbeit an einem breiten Spektrum von Methoden und Anwendungen der Metagenomik und des Cloud-Computings
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Verarbeitung, Analyse und Interpretation von Metagenomdaten verschiedener NGS-Plattformen (u.a. Illumina, ONT, PacBio) im Rahmen verschiedener Kooperationsprojekte
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Entwicklung von Analyse-Workflows unter Einbindung von Container- und Cloud-Technologien (z.B. Docker, Apptainer, S3, OpenStack, Ansible)
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Unterstützung der Abteilung im Bereich administrativer Projektarbeit, z.B. durch das Verfassen von Anträgen und Berichten und die Teilnahme an Projekttreffen
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Unterstützung der Abteilung bei der Planung und Durchführung von Trainingskursen für Wissenschaftler:innen unterschiedlicher Karrierestufen und Fachbereiche
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Veröffentlichung der wissenschaftlichen Ergebnisse in internationalen Fachzeitschriften und Reisen zu Konferenzen
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Austausch mit internen und externen Projektpartnern am IBG-5 und der Universität Bielefeld
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(Co-)Betreuung von Doktorand:innen
Ihr Profil:
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Ein abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master) im Bereich der Bioinformatik, Informatik, Mathematik, Ingenieur-, Natur- oder Wirtschaftswissenschaften bzw. eines verwandten Studiengangs mit anschließender abgeschlossener Promotion
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Erfahrung in Big-Data-Analysen in Verbindung mit Cloud-Technologien und Workflows
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Gute Kenntnisse in der Sequenzanalyse und Metagenomik, insbesondere bei der Verarbeitung von Illumina- und ONT-Daten
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Sehr gute Programmierkenntnisse (z.B. in Python oder vergleichbar) und Kenntnisse in relevanten Technologien (z.B. Git, Docker, Nextflow)
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Sehr sicherer Umgang mit Linux / Unix
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Fließende Englischkenntnisse in Wort und Schrift
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Hohes Maß an Selbstständigkeit und Bereitschaft, sich in komplexe Themen einzuarbeiten
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Sehr zuverlässiger und gewissenhafter Arbeitsstil
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Gute Publikationsleistung
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Bereitschaft zur aktiven Wissensvermittlung, u.a. durch die Unterstützung bei der Planung und Durchführung von Trainingskursen
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Bereitschaft zu Reisen und zur Teilnahme an Konferenzen, Netzwerkveranstaltungen und Projekttreffen
Unser Angebot:
Wir arbeiten an hochaktuellen gesellschaftlich relevanten Themen und bieten Ihnen die Möglichkeit, den Wandel aktiv mitzugestalten! Wir unterstützen Sie in Ihrer Arbeit durch:
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Hochinteressante, interdisziplinär angelegte, abwechslungsreiche Tätigkeit in einem hochaktuellen Themenkomplex
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Teilnahme an Projekttreffen und Konferenzen
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Starke Unterstützung und Mentoring für den Aufbau einer zukünftigen Karriere in der Wissenschaft und/oder der Industrie
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Weiterentwicklung Ihrer persönlichen Stärken, z.B. durch ein umfangreiches Trainingsangebot; ein strukturiertes Weiterbildungsprogramm und Vernetzungsmöglichkeiten speziell für Promovierende über JuDocS, das Jülicher Zentrum für Doktorand:innen und Betreuer:innen: https://www.fz-juelich.de/en/judocs
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Optimale Voraussetzungen zur Vereinbarkeit von Beruf und Privatleben sowie eine familienbewusste Unternehmenspolitik
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Die Möglichkeit zum (orts-)flexiblen Arbeiten, z.B. im Homeoffice, ist grundsätzlich nach Abstimmung und im Einklang mit den anstehenden Aufgaben und (Vor-Ort-)Terminen gegeben
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Vermögenswirksame Leistungen und eine betriebliche Altersvorsorge
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Flexible Arbeitszeitmodelle sowie eine Vollzeittätigkeit, die auch vollzeitnah ausgeübt werden kann
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30 Tage Urlaub sowie alle Brückentage und zwischen Weihnachten und Neujahr immer dienstfrei
Wir bieten Ihnen eine spannende und abwechslungsreiche Aufgabe in einem internationalen und interdisziplinären Arbeitsumfeld. Die Stelle ist auf zwei Jahre befristet mit der Möglichkeit einer längerfristigen Perspektive. Vergütung und Sozialleistungen erfolgen in Abhängigkeit von den vorhandenen Qualifikationen und je nach Aufgabenübertragung im Bereich der Entgeltgruppe 13 nach dem Tarifvertrag für den öffentlichen Dienst (TVöD-Bund).
Neben spannenden Aufgaben und einem kollegialen Miteinander bieten wir Ihnen noch viel mehr: https://go.fzj.de/Benefits.
Dienstort: Bielefeld
Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, z.B. hinsichtlich Alter, Geschlecht, Behinderung, sexueller Orientierung / Identität sowie sozialer, ethnischer und religiöser Herkunft. Ein chancengerechtes, diverses und inklusives Arbeitsumfeld, in dem alle ihre Potenziale verwirklichen können, ist uns wichtig.
Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung bis zum 04.08.2024 über unser Online-Bewerbungsportal.
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