Das Max-Planck-Institut für Ökonomik mit Sitz in Jena wurde 1993 als erstes wirtschafts- wissenschaftliches Institut der Max-Planck-Gesellschaft gegründet. Forschungsschwerpunkt war zunächst die Transformation ehemals sozialistischer Volkswirtschaften. Inzwischen beschäftigt sich das Institut mit einem breiten Spektrum von Fragen wie dem wirtschaftlichen Wandel überhaupt, der experimentellen Ökonomik sowie des unternehmerischen Verhaltens. Das MPI für Ökonomik besteht heute aus zwei Forschungsabteilungen, die Abteilung für Evolutionsökonomik (Direktor: Prof. Dr. Ulrich Witt) und der Abteilung für Strategische Interaktion (Direktor: Prof. Dr. Werner Güth).
Aufbau und Pflege nationaler und internationaler Kooperationen mit anderen Wissenschaftlern, Universitäten und Forschungseinrichtungen sind wichtige Prinzipien des Institutes. Diverse gemeinsame Projekte sowie der rege Austausch mittels Vorträgen, Konferenzen oder Workshops reflektieren diesen Schwerpunkt der Institutsarbeit.
Darüber hinaus engagiert sich das Institut in der Förderung des wissenschaftlichen Nachwuchses. So beteiligt es sich an der Jena Graduate School Human Behavior in Social and Economic Change an der Friedrich-Schiller-Universität in Jena. Vor diesem Hintergrund hat das MPI für Ökonomik mit verschiedenen wissenschaftlichen Partnern zwei Graduiertenprogramme aufgebaut: Die International Max Planck Research School on Adapting Behavior in a Fundamentally Uncertain World (IMPRS Uncertainty) sowie das Doktorandenprogramm "The Economics of Innovative Change".